nob さん、こんにちは。
私も似たような現象に遭遇しました。
少し出力インピーダンスが高めの機材を使って GATE 信号を用意してやった場合、Analog2.0 側の入力インピーダンスが低いと GATE 電圧が下がってしまいます。
具体的には、私の場合は ADSR は 1個なのですが LFO を 2個使っていまして、GATE が正しく掛かってくれないという問題がありました。調べてみると、ADSR と LFO の入力インピーダンスがそれぞれ約 10kΩなので、組み合わせて 3つ使うと約3.3kΩになってしまいます。確かに、ちょっと低めだと思います。
そこで、トランジスタを使ったバッファを追加してやると、解決しました。
nob さんも試してみてはいかがでしょうか?